V bázelskej aglomerácii, ktorá sa nachádza v trojhraničnom regióne a má takmer jeden miliónov obyvateľov sa nachádza 250 obcí. Tie sa rozprestierajú vo švajčiarskych kantónoch Basel-Stadt, Basel-Landschaft, Solothurn a Aargau, v nemeckých okresoch Lörrach, Bad Säckingen a Wehr, a vo francúzskej časti Alsaska, konkrétne v jej južnej oblasti. Vzhľadom na ekonomický význam a atraktívnosť tejto oblasti pre bývanie bola vytvorená inštitucionalizovaná spolupráca na riešenie spoločných záležitostí, koordináciu rozvoja a posilnenie vzťahov medzi verejnými inštitúciami. Euroregión Bázel, založený v roku 2007 ako občianske združenie podľa francúzskeho práva, si kladie za cieľ zlepšiť životné podmienky miestnych obyvateľov a cezhraničných dochádzajúcich. Organizácia sa usiluje o posilnenie hospodárskej konkurencieschopnosti regiónu, zohľadňujúc pritom potreby bývania a životného prostredia, a podporuje spoločné projektové iniciatívy. Medzi členov združenia patria samosprávne subjekty rôznych úrovní, ako sú obce, ich združenia, okresy, kantóny a regióny. Najvyšším orgánom organizačnej štruktúry euroregiónu je Valné zhromaždenie, v ktorom má každý člen združenia jeden hlas. Valné zhromaždenie určuje hlavné smerovanie spolupráce, schvaľuje program, výročnú správu a rozpočet. Zasadá raz ročne a poskytuje priestor na výmenu poznatkov a predstavenie detailov prebiehajúcich projektov.Za každodenné fungovanie združenia nesie zodpovednosť Výkonný výbor, ktorý je zložený z 27 členov – po deväť z každej zúčastnenej krajiny. Ich nomináciu schvaľuje Valné zhromaždenie. Výbor sa stretáva minimálne štyrikrát ročne a pri rozhodovaní má každá krajina právo veta. Výkonný výbor má aj kompetenciu voliť trojčlenné predsedníctvo (predseda a dvaja podpredsedovia), pričom zástupcovia musia pochádzať z rôznych štátov. Funkcie sa každé dva roky rotujú. Predsedníctvo má za úlohu určovať strategické smerovanie spolupráce a dohliadať na dodržiavanie vnútorných pravidiel organizácie.
Štvrtou zložkou organizačnej štruktúry je Zmierovací výbor, ktorý tvorí 20 švajčiarskych, 15 francúzskych a 15 nemeckých členov. Tento výbor zohráva poradnú úlohu pri podpore fungovania TEB prostredníctvom svojich pripomienok a odporúčaní. Výsledky jeho práce – uznesenia, návrhy a stanoviská – sú následne predkladané Výkonnému výboru. Výbor je povinný zasadnúť aspoň dvakrát do roka a vo svojej činnosti sa opiera o šesť špecializovaných podvýborov, ktoré sa venujú konkrétnym témam:
- vzdelávaniu, kultúre, mládeži, športu a regionálnej identite,
- sociálnym veciam, zdravotníctvu a výskumu,
- životnému prostrediu, energetike a poľnohospodárstvu,
- doprave,
- územnému plánovaniu
- hospodárstvu, trhu práce a cestovnému ruchu
Okrem toho pôsobia aj špecializované pracovné skupiny, ktoré združujú odborníkov z jednotlivých tematických oblastí..Tieto skupiny pripravujú podklady pre rozhodnutia Výkonného výboru, navrhujú nové projekty a slúžia ako platforma na výmenu odborných poznatkov a skúseností medzi členmi. Medzi týmito skupinami zohráva dôležitú úlohu najmä technická koordinačná pracovná skupina, ktorá s 24 členmi zabezpečuje prípravu rozhodnutí Výkonného výboru. Celkovo existujú nasledovné pracovné skupiny:
- technická koordinačná pracovná skupina
- pracovná skupina pre územné plánovanie
- pracovná skupina pre mobilitu a dopravu
- pracovná skupina pre občiansku spoločnosť
- pracovná skupina pre trojregionálnu cyklistickú oblasť
- pracovná skupina pre lesníctvo
Spolupráca prevádzkuje aj centrálnu kanceláriu vo francúzskom Village-Neuf. Kancelária v súčasnosti zamestnáva štyroch pracovníkov, ktorí zabezpečujú administratívne a finančné úlohy projektov, koordináciu odborných pracovných skupín, ako aj podporu práce Výkonneho výboru a Predsedníctva vrátane realizácie ich rozhodnutí.
Oddelene od formálnej organizačnej štruktúry ETB, no zároveň u nej vychádzajúc, vznikli politické výbory IBA a 3Land. Obe platformy združujú viacerých vzájomne prepojených projektov. IBA sa zameriava na iniciatívy spojené s medzinárodnou architektonickou výstavou v Bazileji, zatiaľ čo 3Land podporuje rozvoj málo využitých oblastí pozdĺž Rýna.