Jednou z najstarších organizácií zaoberajúcich sa cezhraničnou správou na francúzsko-švajčiarskych hraniciach je Francúzsko-Ženevský regionálny výbor (Comité Régional Franco-Genevois – CRFG), ktorý sa od roku 1973 snaží dohliadať na rozvoj cezhraničnej aglomerácie v Ženeve a podporovať ho. Systém bol vytvorený súčasne s ženevským systémom finančnej kompenzácie (Compensation Financière Genevoise – CFG). CRFG poskytuje orgánom v regióne inštitucionalizovanú formu, v rámci ktorej môžu na vyhradenej platforme diskutovať o cezhraničných otázkach a realizovať spoločné projekty. Spolupráca neponúka možnosť rokovania iba pre dotknuté obce, ale tiež umožňuje zapojenie aktérov na štátnej úrovni. Členmi výboru je päť organizácií z Francúzska a tri zo Švajčiarska, ktoré pozostávajú zo štátnych (Francúzsko a kantóny) a územných (regióny a okresy) subjektov, ako aj zo Združenia ženevských obcí (L’Association des Communes Genevoises – ACG). Z hľadiska organizačnej štruktúry je najvyšším orgánom Fórum politickej spolupráce (Instance Politique de Coopération – IPC), ktorého spolupredsedovia sú predseda francúzskeho regiónu Auvergne-Rhône-Alpes (prefekt) a štátny tajomník kantónu Ženeva zodpovedný za cezhraničné záležitosti. Členstvo fóra dopĺňajú ďalší 4 zástupcovia z francúzskej a švajčiarskej strany a na rokovania sú pozvaní aj štátni zástupcovia zodpovední za zahraničné veci oboch štátov. IPC je rozhodovacím orgánom pre spoluprácu, ktorý sa schádza dvakrát ročne na prerokovanie aktuálnych tém.

Prácu fóra podporujú aj odborné podvýbory, ktoré môžu pôsobiť buď trvalo, alebo dočasne. Ich členmi sú zvolení predstavitelia a odborníci, pričom ich činnosť je zameraná na konkrétnu oblasť alebo projekt. V súčasnosti funguje deväť takýchto podvýborov, ktoré sa venujú témam ako dohľad nad ženevským finančným kompenzačným systémom, poskytovanie cezhraničných štatistických údajov, doprava, bezpečnosť, zdravotníctvo, zamestnanosť a sociálne zabezpečenie, vzdelávanie a výskum, hospodárenie s vodou a ochrana životného prostredia, ako aj energetika. 

Za technické úlohy zodpovedá generálny sekretariát, ktorý okrem iného zabezpečuje organizáciu zasadnutí IPC a odborných konzultácií.

S prehĺbením cezhraničných vzťahov vznikli v rámci CRFG aj nové inštitúcie. Medzi také inštitúcie patrí napríklad Rada Ženevského jazera (Conseil du Léman) založená v roku 1987 a skupina pre cezhraničnú spoluprácu v okolí Ženevy (GLCT Grand Genève) založená v roku 2013.